NLP Santé, Les Rencontres de l’ANS et d’Inria

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Vous êtes un acteur du numérique en santé ? (acteur de la recherche, professionnel de santé, industriel, institutionnel). Vous êtes intéressé(e) pour en savoir plus sur les projets de recherche en santé utilisant du NLP ? Vous souhaitez connaître et comprendre les retours d’expérience de ceux qui utilisent des outils de traitement automatique des langues pour développer des cas d’usage en santé ? Vous souhaitez faire partie de la communauté des acteurs intéressés par le NLP et la Santé?

Ces rencontres sont faites pour vous !

Date : mardi 4 juin 2024 de 17h30 à 19h suivi d’échanges libres autour d’un cocktail networking – pizzas

Format hybride : Paris Santé Campus (rotonde ANS Arena 4e étage) OU en visio

Co-organisé par : l’ANS (Agence du Numérique en Santé) et Inria (Institut national de recherche en sciences et technologies du numérique)

PROGRAMME (FR)

17h30 – Mot d’introduction - ANS et Inria

17h35 – "Présentation Recherche" : Ontologies et modèles de langue pour l’annotation sémantique en psychiatrie. Auteurs : Jean Charlet, Ons Aouina, Jacques Hilbey

Intervenants :

• Jean Charlet, Chercheur en IA appliquée à la santé - AP-HP, LIMICS (Sorbonne Université/INSERM/Sorbonne Paris Nord)
• Ons Aouina, Doctorante Sorbonne Université, LIMICS

Résumé (FR) : Les descriptions en texte libre contenues dans les dossiers patients informatisés revêtent un intérêt significatif pour la recherche clinique et l’optimisation des soins. Toutefois, la capacité des ordinateurs à interpréter directement ce texte libre est limitée, réduisant ainsi sa valeur potentielle. L’annotation sémantique tente de rendre le texte libre des dossiers patients interprétable par les machines mais les performances sont parfois décevantes, particulièrement en français. Ces difficultés sont encore plus marquées dans le domaine psychiatrique où l’on cherche non seulement à extraire les concepts du domaine mais à les normaliser et à extraire les relations de textes décrivant longuement l’histoire d’une maladie d’un patient et ses ascendants. Nous décrirons ici le projet de prévention de la schizophrénie, PsyCARE, son ontologie et le système d’annotation développé dans ce contexte et fondé sur des techniques d’apprentissage non supervisé pour extraire les entités et leurs interrelations en utilisant une ontologie de domaine.

18h15 – "Présentations Entreprises" : Cas d’usages NLP en santé

Synapse Medicine, Apport des LLM pour une prise en charge thérapeutique personnalisée

• Mélanie Wary, Data Scientist
• Guillaume Martin, Medical Affairs Specialist

Quinten Health, Retracer l’évolution d’un patient en oncologie à partir de l’analyse de rapports médicaux

• Lucas Davy, COO - Quinten et CEO - Quinten DM

PraxySanté, PraxyConsultation, l’assistant IA qui transcrit, résume, extrait des données des consultations, RCP, et depuis le dossier patient

• Damien Forest, CEO - PraxySanté

19h00 – Conclusion - ANS et Inria

Echanges libres / Cocktail networking

INTERVENANT “RECHERCHE”

Jean Charlet est chargé de mission à la recherche à l’Assistance Publique – Hôpitaux de Paris. Il mène ses travaux au sein de l’unité mixte de l’INSERM, UMR_S 1142, LIMICS (Laboratoire d’Informatique Médicale et d’Ingénierie des Connaissances en eSanté). Ses principaux domaines d'application concernent le développement de systèmes d'organisation des Connaissances pour l'annotation sémantique en médecine. Jean Charlet travaille spécifiquement sur la construction des ontologies médicales à partir des corpus textuels et sur leur usage dans les systèmes d’annotation et d’intégration sémantique. Ses travaux récents portent sur les normes d'interopérabilité des données pour leur partage entre le dossier patient informatisé et la recherche clinique et le développement d’ontologies pour l’intégration des données hétérogènes pour la prévention (projet RHU PsyCARE – http://psy-care.fr) ou le soin (projet EIT-Health SUOG – http://www.suog.org/). Depuis 2013, il est co-éditeur de la section « Knowledge Representation and Management » de l'IMIA Yearbook of Medical Informatics. Jean Charlet maintient la page Web de l’INSERM sur l’IA et la santé : https://www.inserm.fr/dossier/intelligence-artificielle-et-sante/

PROGRAM (EN)

17h30 – Introduction

17h35 – “Research Presentation”: Ontology and Language Model for Semantic annotation in Psychiatric field. Authors: Jean Charlet, Ons Aouina, Jacques Hilbey

Speakers:

• Jean Charlet, AP-HP, LIMICS (Sorbonne Université, INSERM, Sorbonne Paris Nord)
• Ons Aouina, PhD Candidate, Sorbonne Université, LIMICS

Abstract (EN): Free text descriptions contained in EHR are of significant interest for clinical research and care optimization. However, the ability of computers to directly interpret this free text is limited, thus reducing its potential value. Semantic annotation attempts to make the free text of patient records interpretable by computers, but performance is sometimes disappointing, particularly in French. These difficulties are even more marked in the psychiatric field, where the aim is not only to extract concepts from the field, but also to normalize them and extract relationships from texts describing at length the history of a patient's illness and his or her ancestors. Here we describe the schizophrenia prevention project, PsyCARE, its ontology and the annotation system developed in this context, based on unsupervised learning techniques to extract entities and their interrelations using a domain ontology.

18h15 – "Industry Presentations": NLP use cases in healthcare

Synapse Medicine – [https://www.synapse-medicine.com/]

Quinten Health - [https://www.quinten-health.com/]

PraxySanté - [https://praxysante.fr/]

19h00 – Conclusion

Free exchanges and networking lunch